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Spieler wählen in Spyborgs zwei der verfügbaren drei Hauptcharaktere aus und nutzen die auf Bewegung basierte Wii-Remote-Steuerung, um die Feindesscharen mit Schuss-, Hieb- und Prügel-Attacken in ihre Schranken zu weisen. Die gesamte Spielerfahrung basiert auf dem Team-Gedanken, so dass auch im Single-Player-Modus zwischen den zwei auf dem Bildschirm agierenden Figuren hin- und hergeschaltet werden kann.